Костел и монастырь были построены в 1636-1658 гг. с целью передать их бернардинкам, прибывшим в Люблин в начале XVII в. Обе постройки учредил  Петр Черны из Витовиц. В первой половине XVIII в. к костелу пристроили башню. Его сегодняшний вид – результат перестройки после пожара в 1768 г.

В 1864 году произошла ликвидация ордена бернардинок. После выезда монахинь постройки был переданы епархиальным священникам. После 1918 г. имущество  вернули бернардинкам, однако они передали их иезуитам (1920 г.).

Интерьер костела украшает иллюзионистская необарочная полихромия, создателем которой был люблинский живописец Владислав Барвицки (1897 г.). В главном алтаре находится картина пол. XX w. с изображением св. Петра Сомневающегося кисти Антони Михаляка. Вход в костел в настоящее время возможен со стороны ул. Крулевской, восле памятника кс. Ежи Попелушко.