Бернардинцы прибыли в Люблин в половине XV в.  Примерно в 1460 г. начали постройку деревянного костела и монастыря. Постройка каменного храма продолжалась от 70-ых годов до конца XV в., на переломе XV и XVI вв. здесь возник также каменный монастырь. После пожара в 1602 г. костел был перестроен, получил вид трехнефной базилики с прилегающими шести часовнями. Свод был покрыт сохранившимися до нашего времени лепными украшениями типа люблинского ренессанса, которые стали образцом для многих украшений такого типа в Люблинском регионе. К временам XVII-вечной перестройки восходит также характерная восточная вершина костела с оковочным орнаментом.

Костел начал быстро внушать симпатию люблинских мещан, а их многочисленные фонды привели к тому, что оснащение интерьера принадлежит к самым интересным в Люблине. Внимание привлекают алтари в стиле позднего барокко, над которыми работали, например, Фридерик Каргер и Себастьян Цайсель (скульпторы, связанные с семьей Чарторыских в Пулавах). В главном алтаре находится чудесная икона св. Антония. В одном из боковых алтарей хранятся мощи св. Валентина. Кроме того, в костеле много ренессансных надгробий и эпитафийных таблиц, в том числе Войцеха Очко, придворного врача последних Ягеллогов и Стефана Батория.